《深湖巨兽》的故事发生在二战结束几十年后的加拿大，美国石油公司为了勘测北极冰层下的石油资源，开发出价值50亿美元的高科技设备。但设备却在广袤的加拿大深水湖湖区神秘失踪，消失在一片广袤湖区之中。